Сравнительная оценка патогенного потенциала энтерококков, выделенных от здоровых людей и из сточных вод

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Эффективная работа очистных сооружений — важнейший фактор защиты здоровья общества. При этом требования к очистке и обеззараживанию сточных вод предполагают снижение количества бактерий до нормативного уровня, не учитывая патогенного потенциала выживших бактерий в воде, попадающей после обеззараживания в поверхностные водоёмы. Представляется актуальным оценить влияние очистных сооружений именно на патогенный потенциал бактерий. В настоящей работе это выполняется на примере изолятов Enterococcus, так как энтерококки, имеющие патогенный потенциал, представляют собой серьёзную угрозу здоровью человека, вызывая инфекционно-воспалительные поражения клапанов сердца, мочеполовой системы и другие заболевания.

Материалы и методы. Патогенный потенциал энтерококков оценивали по детектированию в выделенной из изолятов ДНК потенциально патогенных генов методом ПЦР. Детектировали гены адгезивных белков (Esp, Asa1), лизирующих белков (цитолизина CylA, гиалуронидазы hyl и желатиназы gelE) и факторов устойчивости к антибиотикам (vanA, vanB). В работе проведена сравнительная оценка наличия патогенного потенциала у 366 изолятов бактерий рода Enterococcus, выделенных из образцов воды со станций очистки сточных вод Москвы и Московской области, и 168 изолятов, выделенных из кала людей из контрольной группы без колопроктологических заболеваний.

Результаты. Процент изолятов бактерий рода Enterococcus, обладающих патогенным потенциалом, различался для разных очистных станций (от 36 до 55%), причём этот показатель не зависел от объёма обрабатываемых сточных вод и схемы очистки. Видовой состав энтерококков, выделенных из сточных вод очистных сооружений, в целом сходен с видовым составом изолятов энтерококков, выделенных из кала, который представлен следующими видами: доминировали E. faecium (36 и 53% соответственно), E. faecalis (28 и 38%). Следующие по представленности виды, выделенные из сточных вод и кишечной микробиоты, отличались соответственно: E. hirae (24 и 1,2%) и E. casseliflavus (3 и 0,6%). E. durans, E. thailandicus, E. avium, E. mundtii представлены в порядке убывания от 2,5 до 1%, одинаково в обеих выборках. Минорные виды E. raffinosus, E. moraviensis, E. malodatus представлены единичными изолятами из очистных сооружений, E. canintеstini — из кала людей. По проценту наличия изолятов энтерококков, имеющих патогенный потенциал, в обеих выборках с большим отрывом лидирует E. faecalis (75–80%). Гены устойчивости к ванкомицину в данной выборке не выявлены. Из патогенных генов чаще остальных встречались gelE (30–33% из обоих источников) и asa1 (18–19%). Ген esp представлен различно (9% из очистных, 14% из кала), а ген cylA одинаково (4,4–4,8%). Ген гиалуронидазы hyl выявлялся только в изолятах из очистных сооружений (2,5%), причём у всех неминорных видов (E. faecium, E. faecalis, E. hirae, E. durans, E. thailandicus) и на разных стадиях очистки. Работа очистных сооружений не оказывала видимого влияния на процент изолятов энтерококков, имеющих патогенный потенциал и спектр генов патогенности. Из обследованных точек отбора (до очистки, после цикла очистки, активный ил, поверхностные воды) наибольший патогенный потенциал демонстрировали изоляты из активного ила.

Ограничения исследования. При изучении патогенного потенциала изолятов энтерококков из очистных сооружений Москвы и Московской области и кала практически здоровых людей проведено сравнение двух выборок, из 366 и 168 изолятов соответственно, что представляет собой достаточную референтную выборку. Выборка ограничена по географии, таким образом, выводы можно применять к очистным сооружениям Москвы и Московской области, где использовались сходные схемы очистки.

Заключение. Полученные данные свидетельствуют, что патогенный потенциал энтерококков, выделенных из сточных вод очистных сооружений, несколько выше, чем у изолятов, выделенных из кишечной микробиоты пациентов из контрольной выборки группы практически здоровых людей. Установлено, что наибольшим патогенным потенциалом обладали изоляты, выделенные из активного ила, поступающего в аэротенк со сточными водами. При этом активный ил может выступать в роли резервуара накопления бактерий, обладающих патогенным потенциалом и потенциального распространения их в окружающую среду.

Соблюдение этических стандартов. Исследование биологического материала от людей одобрено Локальным независимым этическим комитетом (протокол № 98А заседания Локального независимого этического комитета ФГБУ «ГНЦК им. А.Н. Рыжих» Минздрава России от 16.07.2018 г.).

Участие авторов:
Пай Г.В. — концепция и дизайн исследования, выполнение экспериментальной работы, статистическая обработка, написание текста, редактирование;
Ракитина Д.В. — написание текста;
Панькова М.А. — сбор и обработка образцов, культивирование бактерий;
Федец З.Е. — сбор и обработка образцов, культивирование бактерий;
Мания Т.Р. — сбор материала, редактирование;
Загайнова А.В. — концепция и дизайн исследования, редактирование, утверждение окончательного варианта статьи.

Конфликт интересов. Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов в связи с публикацией данной статьи.

Финансирование. Исследование проведено в рамках НИР «Разработка унифицированных методов, включающих отбор проб, для осуществления определения микробиологического и паразитологического загрязнения сточных вод» (шифр «Сточные воды»). Госконтракт 12.11.2021 г. № 2123388100152000000000000/145.001.216.

Поступила: 31.07.2023 / Принята к печати: 15.11.2023 / Опубликована: 28.12.2023

Об авторах

Галина Васильевна Пай

ФГБУ «Центр стратегического планирования и управление медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-7086-0899

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологии и паразитологии ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, г. Москва, ул. Погодинская, 10

e-mail: Pay@cspmz.ru 

Россия

Дарья Викторовна Ракитина

ФГБУ «Центр стратегического планирования и управление медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Email: noemail@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-3554-7690

Кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологии и паразитологии ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, г. Москва, ул. Погодинская, 10

e-mail: Rakitina@cspmz.ru 

Россия

Марина Николаевна Панькова

ФГБУ «Центр стратегического планирования и управление медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Email: noemail@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-9133-3665

Биолог лаборатории микробиологии и паразитологии ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, г. Москва, ул. Погодинская, 10

e-mail: MPankova@cspmz.ru

Россия

Злата Евгеньевна Федец

ФГБУ «Центр стратегического планирования и управление медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Email: noemail@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-2396-9231

Младший научный сотрудник лаборатории микробиологии и паразитологии ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, г. Москва, ул. Погодинская, 10

e-mail: Fedets@cspmz.ru

Россия

Тамари Резоевна Мания

ФГБУ «Центр стратегического планирования и управление медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Email: noemail@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6295-661X

Науч. сотр. лаб. микробиологии и паразитологии ФГБУ «ЦСП» ФМБА России 119121, Москва, Россия\

e-mail: TManiya@cspmz.ru

 

Россия

Анжелика Владимировна Загайнова

ФГБУ «Центр стратегического планирования и управление медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Email: noemail@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-4772-9686

Кандидат биологических наук, заведующий лаборатории микробиологии и паразитологии ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, г. Москва, ул. Погодинская, 10

e-mail: AZagaynova@cspmz.ru

Россия

Список литературы

  1. Журавлёв П.В., Хуторянина И.В., Марченко Б.И. Барьерная роль очистных сооружений канализации в отношении санитарно-показательных и патогенных бактерий, паразитарных агентов на примере южной зоны России. Гигиена и санитария. 2021; 100(10): 1070–6. https://doi.org/10.47470/0016-9900-2021-100-10-1070-1076 https://elibrary.ru/rmypum
  2. Zhao-Fleming H.H., Wilkinson J.E., Larumbe E., Dissanaike S., Rumbaugh K. Obligate anaerobes are abundant in human necrotizing soft tissue infection samples – a metagenomics analysis. APMIS. 2019; 127(8): 577–87. https://doi.org/10.1111/apm.12969
  3. Libertucci J., Bassis C.M., Cassone M., Gibson K., Lansing B., Mody L., et al. Bacteria detected in both urine and open wounds in nursing home residents: a pilot study. mSphere. 2019; 4(4): e00463–19. https://doi.org/10.1128/mSphere.00463-19
  4. Shrestha L.B., Baral R., Poudel P., Khanal B. Clinical, etiological and antimicrobial susceptibility profile of pediatric urinary tract infections in a tertiary care hospital of Nepal. BMC Pediatr. 2019; 19(1): 36. https://doi.org/10.1186/s12887-019-1410-1
  5. Оганян К.А., Аржанова О.Н., Зациорская С.Л., Савичева А.М. Энтерококки и их роль в перинатальной патологии. Журнал акушерства и женских болезней. 2015; 64(5): 48–54. https://elibrary.ru/tgpsyy
  6. Layton B.A., Walters S.P., Lam L.H., Boehm A.B. Enterococcus species distribution among human and animal hosts using multiplex PCR. J. Appl. Microbiol. 2010; 109(2): 539–47. https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2010.04675.x
  7. Boehm A.B., Sassoubre L.M. Enterococci as indicators of environmental fecal contamination. In: Gilmore M.S., Clewell D.B., Ike Y., Shankar N., eds. Enterococci: From Commensals to Leading Causes of Drug Resistant Infection. Boston: Massachusetts Eye and Ear Infirmary; 2014.
  8. Bahirathan M., Puente L., Seyfried P. Use of yellow-pigmented enterococci as a specific indicator of human and nonhuman sources of faecal pollution. Can. J. Microbiol. 1998; 44(11): 1066–71. https://doi.org/10.1139/cjm-44-11-1066
  9. Ferguson D.M., Moore D.F., Getrich M.A., Zhowandai M.H. Enumeration and speciation of enterococci found in marine and intertidal sediments and coastal water in southern California. J. Appl. Microbiol. 2005; 99(3): 598–608. https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2005.02660.x
  10. Wheeler A.L., Hartel P.G., Godfrey D.G., Hill J.L., Segars W.I. Potential of Enterococcus faecalis as a human fecal indicator for microbial source tracking. J. Environ. Qual. 2002; 31(4): 1286–93. https://doi.org/10.2134/jeq2002.1286
  11. Ben Said L., Klibi N., Lozano C., Dziri R., Ben Slama K., Boudabous A., et al. Diversity of enterococcal species and characterization of high-level aminoglycoside resistant enterococci of samples of wastewater and surface water in Tunisia. Sci. Total. Environ. 2015; 530–531: 11–7. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2015.05.091
  12. Łuczkiewicz A., Jankowska K., Kurlenda J., Olańczuk-Neyman K. Identification and antimicrobial resistance of Enterococcus spp. isolated from surface water. Water Sci. Technol. 2010; 62(2): 466–73. https://doi.org/10.2166/wst.2010.909
  13. Vankerckhoven V., Van Autgaerden T., Vael C., Lammens C., Chapelle S., Rossi R., et al. Development of a multiplex PCR for the detection of asa1, gelE, cylA, esp, and hyl genes in enterococci and survey for virulence determinants among European hospital isolates of Enterococcus faecium. J. Clin. Microbiol. 2004; 42(10): 4473–9. https://doi.org/10.1128/JCM.42.10.4473-4479.2004
  14. Galli D., Lottspeich F., Wirth R. Sequence analysis of Enterococcus faecalis aggregation substance encoded by the sex pheromone plasmid pAD1. Mol. Microbiol. 1990; 4(6): 895–904. https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.1990.tb00662.x
  15. Guzmàn C.A., Pruzzo C., LiPira G., Calegari L. Role of adherence in pathogenesis of Enterococcus faecalis urinary tract infection and endocarditis. Infect. Immun. 1989; 57(6): 1834–8. https://doi.org/10.1128/iai.57.6.1834-1838.1989
  16. Gutschik E., Møller S., Christensen N. Experimental endocarditis in rabbits. 3. Significance of the proteolytic capacity of the infecting strains of Streptococcus faecalis. Acta Pathol. Microbiol. Scand. B. 1979; 87(6): 353–62.
  17. Chow J.W., Thal L.A., Perri M.B., Vazquez J.A., Donabedian S.M., Clewell D.B., et al. Plasmid-associated hemolysin and aggregation substance production contribute to virulence in experimental enterococcal endocarditis. Antimicrob. Agents Chemother. 1993; 37(11): 2474–7. https://doi.org/10.1128/AAC.37.11.2474
  18. Ike Y., Hashimoto H., Clewell D.B. High incidence of hemolysin production by Enterococcus (Streptococcus) faecalis strains associated with human parenteral infections. J. Clin. Microbiol. 1987; 25(8): 1524–8. https://doi.org/10.1128/jcm.25.8.1524-1528.1987
  19. Shankar N., Lockatell C.V., Baghdayan A.S., Drachenberg C., Gilmore M.S., Johnson D.E. Role of Enterococcus faecalis surface protein Esp in the pathogenesis of ascending urinary tract infection. Infect. Immun. 2001; 69(7): 4366–72. https://doi.org/10.1128/IAI.69.7.4366-4372.2001
  20. Toledo-Arana A., Valle J., Solano C., Arrizubieta M.J., Cucarella C., Lamata M., et al. The enterococcal surface protein, Esp, is involved in Enterococcus faecalis biofilm formation. Appl. Environ. Microbiol. 2001; 67(10): 4538–45. https://doi.org/10.1128/AEM.67.10.4538-4545.2001
  21. Woodford N., Soltani M., Hardy K.J. Frequency of esp in Enterococcus faecium isolates. Lancet. 2001; 358(9281): 584. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(01)05726-9
  22. Kariyama R., Mitsuhata R., Chow J.W., Clewell D.B., Kumon H. Simple and reliable multiplex PCR assay for surveillance isolates of vancomycin-resistant enterococci. J. Clin. Microbiol. 2000; 38(8): 3092–5. https://doi.org/10.1128/JCM.38.8.3092-3095.2000
  23. Loge F.J., Emerick R.W., Ginn T.R., Darby J.L. Association of coliform bacteria with wastewater particles: impact of operational parameters of the activated sludge process. Water Res. 2002; 36(1): 41–8. https://doi.org/10.1016/s0043-1354(01)00204-4
  24. Zhang Y., Marrs C.F., Simon C., Xi C. Wastewater treatment contributes to selective increase of antibiotic resistance among Acinetobacter spp. Sci. Total. Environ. 2009; 407(12): 3702–6. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2009.02.013
  25. Hynes W.L., Walton S.L. Hyaluronidases of Gram-positive bacteria. FEMS Microbiol. Lett. 2000; 183(2): 201–7. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2000.tb08958.x
  26. Rice L.B., Carias L., Rudin S., Vael C., Goossens H., Konstabel C., et al. A potential virulence gene, hylEfm, predominates in Enterococcus faecium of clinical origin. J. Infect. Dis. 2003; 187(3): 508–12. https://doi.org/10.1086/367711
  27. Auerbach E.A., Seyfried E.E., McMahon K.D. Tetracycline resistance genes in activated sludge wastewater treatment plants. Water Res. 2007; 41(5): 1143–51. https://doi.org/10.1016/j.watres.2006.11.045
  28. Fiore E., Van Tyne D., Gilmore M.S. Pathogenicity of Enterococci. Microbiol. Spectr. 2019; 7(4): 10.1128/microbiolspec.GPP3-0053-2018. https://doi.org/10.1128/microbiolspec.GPP3-0053-2018
  29. Ferreira da Silva M., Tiago I., Veríssimo A., Boaventura R.A., Nunes O.C., Manaia C.M. Antibiotic resistance of enterococci and related bacteria in an urban wastewater treatment plant. FEMS Microbiol. Ecol. 2006; 55(2): 322–9. https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2005.00032.x
  30. Salem-Bekhit F.F., Posch J., Feierl G., Wüst G., Haas D., Ruckenbauer G., et al. Antibiotic resistance of E. coli in sewage and sludge. Water Res. 2003; 37(8): 1685–90. https://doi.org/10.1016/S0043-1354(02)00569-9
  31. Piccinini D., Bernasconi E., Di Benedetto C., Martinetti Lucchini G., Bongiovanni M. Enterococcus hirae infections in the clinical practice. Infect. Dis. (Lond.). 2023; 55(1): 71–3. https://doi.org/10.1080/23744235.2022.2125066
  32. Yoshino Y. Enterococcus casseliflavus infection: a review of clinical features and treatment. Infect. Drug Resist. 2023; 16: 363–8. https://doi.org/10.2147/IDR.S398739
  33. Alipour M., Hajiesmaili R., Talebjannat M., Yahyapour Y. Identification and antimicrobial resistance of Enterococcus spp. isolated from the river and coastal waters in northern Iran. ScientificWorldJournal. 2014; 2014: 287458. https://doi.org/10.1155/2014/287458
  34. Gotkowska-Płachta A. The prevalence of virulent and multidrug-resistant Enterococci in river water and in treated and untreated municipal and hospital wastewater. Int. J. Environ. Res. Public Health. 2021; 18(2): 563. https://doi.org/10.3390/ijerph18020563
  35. Jahangiri S., Talebi M., Eslami G., Pourshafie M.R. Prevalence of virulence factors and antibiotic resistance in vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolated from sewage and clinical samples in Iran. Indian J. Med. Microbiol. 2010; 28(4): 337–41. https://doi.org/10.4103/0255-0857.71828
  36. Jannati E., Amirmozaffari N., Saadatmand S., Arzanlou M. Faecal carriage of high-level aminoglycoside-resistant and ampicillin-resistant Enterococcus species in healthy Iranian children. J. Glob. Antimicrob. Resist. 2020; 20: 135–44. https://doi.org/10.1016/j.jgar.2019.06.022
  37. Motallebi M., Seyyedi Z.S., Azadchehr M.J. Genetic diversity, antimicrobial resistance, and virulence factors of Enterococcus faecalis isolates obtained from stool samples of hospitalized patients. Jundishapur. J. Microbiol. 2022; 15(6): e121379. https://doi.org/10.5812/jjm-121379

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Пай Г.В., Ракитина Д.В., Панькова М.Н., Федец З.Е., Мания Т.Р., Загайнова А.В., 2024



СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 37884 от 02.10.2009.