Грибы, ассоциированные с растениями картофеля и томата с симптомами грибных болезней в Республике Мали

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В настоящей работе исследованы штаммы грибов, выделенные из пораженных болезнями клубней картофеля и зеленых плодов томата с орошаемых полей небольших фермерских хозяйств, расположенных в округе Бамако и в областях Куликоро и Сегу (Юго-Запад Мали). Всего проанализировано 22 изолята с клубней картофеля и пять с плодов томата. Определение видовой принадлежности показало, что как на картофеле, так и на томате среди выделенных в чистые культуры преобладают штаммы рода Fusarium. Кроме того, на клубнях были обнаружены штаммы Clonostachys rosea и Geotrichum candidum, а на плодах томата – Colletotrichum truncatum и крупноспоровые Alternaria solani s. l. Определение видового состава рода Fusarium показало, что исследуемые штаммы, выделенные с картофеля, принадлежат к 9 видам из 5 видовых комплексов: Fusarium oxysporum species complex (FOSC) – F. glycines, F. nirenbergiae, F. triseptatum; F. solani species complex (FSSC) – F. solani, F. falciforme; F. sambucinum species complex (FSamSC) – F. culmorum; F. incarnatum-equiseti species complex (FIESC) – F. caatingaense, F. duofalcatisporum; F. tricinctum species complex (FTrSC) – F. flocciferum. Все штаммы с томата относились к комплексу FIESC, внутри которого были выявлены два вида: F. duofalcatisporum и отсутствующий на картофеле F. incarnatum. Анализ патогенности на ломтиках клубней картофеля и плодов томата показал, что все исследуемые штаммы были способны поражать живые ткани тестируемых растений. На ломтиках томата активность большинства штаммов была менее выражена, чем на ломтиках картофеля. Оценка устойчивости к фунгицидам показала, что все исследуемые штаммы чувствительны к дифеноконазолу. Анализ устойчивости к тиабендазолу выявил высокоустойчивые штаммы, относящиеся к видам Geotrichum candidum и Alternaria solani s. l. Остальные штаммы, включая Fusarium spp., были чувствительны к тиабендазолу. Наличие устойчивых штаммов важно учитывать при разработке эффективных стратегий защиты растений.

Об авторах

А. С. Еланский

Российский университет дружбы народов им. Патриса Лумумбы, 117198 Москва, Россия

Email: sasha.elansky@gmail.com

Д. Симбо

Российский университет дружбы народов им. Патриса Лумумбы, 117198 Москва, Россия

Email: 1042215234@rudn.ru

С. Н. Еланский

Российский университет дружбы народов им. Патриса Лумумбы, 117198 Москва, Россия; Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, 119991 Москва, Россия

Email: snelansky@mail.ru

Е. Н. Пакина

Российский университет дружбы народов им. Патриса Лумумбы, 117198 Москва, Россия

Email: pakina_en@pfur.ru

Е. М. Чудинова

Российский университет дружбы народов им. Патриса Лумумбы, 117198 Москва, Россия

Email: chudiel@mail.ru

Список литературы

  1. Abdurahman A., Parker M.L., Kreuze J. et al. Molecular epidemiology of Ralstonia solanacearum species complex strains causing bacterial wilt of potato in Uganda. Phytopathology. 2019. V. 109. P. 1922–1931. https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-18-0476-R
  2. Afolabi O.O., Bigirimana V.d.P., Hua G.K.H. et al. Fusarium and Sarocladium species associated with rice sheath rot disease in sub-Saharan Africa. Diversity. 2023. V. 15. Art. 1090. https://doi.org/10.3390/d15101090
  3. Azil N., Stefańczyk E., Sobkowiak S. et al. Identification and pathogenicity of Fusarium spp. associated with tuber dry rot and wilt of potato in Algeria. Eur. J. Plant Pathol. 2021. Т. 159 (3). С. 495–509. https://doi.org/10.1007/s10658-020-02177-5
  4. Brizuela A.M., De la Lastra E., Marin-Guirao J.I. et al. Fusarium consortium populations associated with Asparagus crop in Spain and their role on field decline syndrome. J. Fungi (Basel). 2020. V. 6 (4). Art. 336. https://doi.org/10.3390/jof6040336
  5. Byarugaba A.A., Mukasa S.B., Barekye A. et al. Interactive effects of Potato virus Y and Potato leafroll virus infection on potato yields in Uganda. Open Agriculture. 2020. V. 5. P. 726–739. https://doi.org/10.1515/opag-2020-0073
  6. Chingle W., Kwon-Ndung E. Managing the menace of late blight disease of potato using field resistance in Jos Plateau, Nigeria. Int. J. Innov. Approaches Agric Res. 2019. V. 3. P. 210–216. https://doi.org/10.29329/ijiaar.2019.194.7
  7. Christian C.L., Rosnow J., Woodhall J.W. et al. Pathogenicity of Fusarium species associated with potato dry rot in the Pacific Northwest of the United States. Plant Dis. 2024. https://doi.org/10.1094/PDIS-10-24-2136-RE
  8. Dean R., Van kan J.A.L., Pretorius Z.A. et al. The Top 10 fungal pathogens in molecular plant pathology. Molec. Plant Pathol. 2012. V. 13 (4). P. 414–430. https://doi.org/10.1111/j.1364-3703.2011.00783.x
  9. Debourgogne A., Gueidan C., de Hoog S. et al. Comparison of two DNA sequence-based typing schemes for the Fusarium solani species complex and proposal of a new consensus method. J. Microbiol. Methods. 2012. V. 91 (1). P. 65–72. https://doi.org/10.1016/j.mimet.2012.07.012
  10. Diao Y.Z., Zhang C., Lin D. et al. First report of Colletotrichum truncatum causing anthracnose of tomato in China. Plant disease. 2014. V. 98 (5). P. 687. https://doi.org/10.1094/PDIS-05-13-0491-PDN
  11. Domsch K.H., Gams W., Anderson T.H. Compendium of Soil Fungi. IHW-Verl, Eching. 2007.
  12. Du M., Ren X., Sun Q. et al. Characterization of Fusarium spp. causing potato dry rot in China and susceptibility evaluation of Chinese potato germplasm to the pathogen. Potato Res. 2012. V. 55. P. 175–184. https://doi.org/10.1007/s11540-012-9217-6
  13. Elansky A.S., Mislavskiy S.M., Chudinova E.M. et al. Fusarium species affecting potato tubers and tomato fruits in Uganda. Mikologiya i fitopatologiya. 2024. V. 58 (2). P. 161–172. https://doi.org/10.31857/S0026364824020077
  14. Engalycheva I., Kozar E., Frolova S. et al. Fusarium species causing pepper wilt in Russia: Molecular Identification and Pathogenicity. Microorganisms. 2024. V. 12. Art. 343. https://doi.org/10.3390/microorganisms12020343
  15. Gachango E. Hanson L.E., Rojas A. et al. Fusarium spp. causing dry rot of seed potato tubers in Michigan and their sensitivity to fungicides. Plant Disease. 2012. V. 96. P. 1767–1774. https://doi.org/10.1094/PDIS-11-11-0932-RE
  16. Gavrilova O., Orina A., Trubin I. et al. Identification and pathogenicity of Fusarium fungi associated with dry rot of potato tubers. Microorganisms. 2024. V. 12. Art. 598. https://doi.org/10.3390/microorganisms12030598
  17. Harahagazwe D., Condori B., Barreda C. et al. How big is the potato (Solanum tuberosum L.) yield gap in Sub-Saharan Africa and why? A participatory approach. Open Agriculture. 2018. V. 3. P. 180–189. https://doi.org/10.1515/opag-2018-0019
  18. Ifeduba A.M., Kwon-Ndung E.H., Shutt V.M. et al. Genetic diversity of late blight (Phytophthora infestans) populations of potato (Solanum tuberosum L.) in Jos Plateau State, Nigeria. Australian J. Sci. Technol. 2021. V. 5 (4). P. 702–708.
  19. Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35 (6). P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  20. Laraba I., McCormick S.P., Vaughan M.M. et al. Phylogenetic diversity, trichothecene potential, and pathogenicity within Fusarium sambucinum species complex. PLOS One. 2021. V. 16 (1). Art. e0245037. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0245037
  21. Liu Y.J., Whelen S., Hall B.D. Phylogenetic relationships among ascomycetes: evidence from an RNA polymerase II subunit. Molec. Biol. Evol. 1999. V. 16 (12). P. 1799–1808. http://dx.doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026092
  22. Lombard L., Sandoval-Denis M., Lamprecht S.C. et al. Epitypification of Fusarium oxysporum – clearing the taxonomic chaos. Persoonia. 2019. V. 43. P. 1–47. https://doi.org/10.3767/persoonia.2019.43.01
  23. Lombard L., van Doorn R., Groenewald J.Z. et al. Fusarium diversity associated with the Sorghum-Striga interaction in Ethiopia. Fungal Syst. Evol. 2022. V. 10. P. 177–215. https://doi.org/10.3114/fuse.2022.10.08
  24. Namugga P., Sibiya J., Melis R. et al. Yield response of Potato (Solanum tuberosum L.) genotypes to late blight caused by Phytophthora infestans in Uganda. Am. J. Pot. Res. 2018. V. 95. P. 423–434. https://doi.org/10.1007/s12230-018-9642-4
  25. Niessen L., Grafenhan T., Vogel R.F. ATP citrate lyase 1 (acl1) gene-based loop-mediated amplification assay for the detection of the Fusarium tricinctum species complex in pure cultures and in cereal samples. Int. J. Food Microbiol. 2012. V. 158 (3). P. 171–185. https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2012.06.021
  26. Njoroge A.W., Andersson B., Yuen J.E. et al. Greater aggressiveness in the 2_A1 lineage of Phytophthora infestans may partially explain its rapid displacement of the US-1 lineage in east Africa. Plant Pathol. 2019. V. 68. P. 566–575. https://doi.org/10.1111/ppa.12977
  27. Njoroge A.W., Tusiime G., Forbes G.A. et al. Displacement of US-1 clonal lineage by a new lineage of Phytophthora infestans on potato in Kenya and Uganda. Plant Pathol. 2016. V. 65. P. 587–592. https://doi.org/10.1111/ppa.12451
  28. O’Donnell K., Kistler H.C., Cigelnik E. et al. Multiple evolutionary origins of the fungus causing Panama disease of banana: Concordant evidence from nuclear and mitochondrial gene genealogies. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. P. 2044–2049. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026092
  29. O’Donnell K., Whitaker B.K., Laraba I. et al. DNA sequence-based identification of Fusarium: A work in progress. Plant Dis. 2022. V. 106 (6). P. 1597–1609. https://doi.org/10.1094/PDIS-09-21-2035-SR
  30. Saini T.J., Gupta S.G., Anandalakshmi R. Detection of tomato anthracnose caused by Colletotrichum truncatum in India. Australasian Plant Dis. Notes. 2017. V. 12. P. 48. https://doi.org/10.1007/s13314-017-0271-4
  31. Sandoval-Denis M., Costa M., Broders K. et al. An integrative re-evaluation of the Fusarium sambucinum species complex. Stud. Mycol. 2024. V. 110. P. 1–110. http://dx.doi.org/10.3114/sim.2025.110.01
  32. Shahriar S.A., Husna A., Paul T.T. et al. Colletotrichum truncatum causing anthracnose of tomato (Solanum lycopersicum L.) in Malaysia. Microorganisms. 2023. V. 11. P. 226. https://doi.org/10.3390/microorganisms11010226
  33. Skokov D.N., Tsindeliani A.A., Khasbiullina O.I. Mycobiota of potato tubers grown in Kamchatka Krai. Mikologiya i fitopatologiya. 2025. (In press).
  34. Stefańczyk E., Sobkowiak S., Brylińska M. et al. Diversity of Fusarium spp. associated with dry rot of potato tubers in Poland. Eur. J. Plant Pathol. 2016. V. 145. P. 871–884. https://doi.org/10.1007/s10658-016-0875-0
  35. Tamura K., Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molec. Biol. Evol. 1993. V.10. P. 512–526.
  36. Villafana R.T., Ramdass A.C., Rampersad S.N. First Report of Colletotrichum truncatum Causing Anthracnose in Tomato Fruit in Trinidad. Plant Dis. 2018. V. 102 (9). P 1857. https://doi.org/10.1094/PDIS-02-18-0319-PDN
  37. Watanabe M., Yonezawa T., Lee K. et al. Molecular phylogeny of the higher and lower taxonomy of the Fusarium genus and differences in the evolutionary histories of multiple genes. BMC Evol. Biol. 2011. V. 11. P. 322. https://doi.org/10.1186/1471-2148-11-322
  38. White T.J., Bruns T., Lee S.J.W.T. et al. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: M.A. Innis etc. (eds). PCR-protocols and applications – a laboratory manual. Academic Press, San Diego, 1990, pp. 315–322.
  39. Xia J.W., Sandoval-Denis M., Crous P.W. et al. Numbers to names – restyling the Fusarium incarnatum-equiseti species complex. Persoonia. 2019. V. 43 P. 186–221. https://doi.org/10.3767/persoonia.2019.43.05
  40. Yarmeeva M., Kutuzova I., Kurchaev M. et al. Colletotrichum species on cultivated Solanaceae crops in Russia. Agriculture. 2023. V. 13 (3). Art. 511. https://doi.org/10.3390/agriculture13030511
  41. Yarmeeva M.M., Chudinova E.M., Elanskaya A.S. et al. Fungi of the genus Fusarium on tomato plants in Russia. Mikologiya i fitopatologiya. 20252025. V.59(2). P.169-180. https://doi.org/10.31857/S0026364825020058

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025