Поиск бактериофагов, специфичных в отношении бактерий рода Rhodococcus

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Впервые были выделены бактериофаги, специфичные для Rhodococcus aetherivorans, и впервые была показана перспективность беспозвоночных (в частности, Hyalophora cecropia, Eisenia fetida) как объектов для скрининга фаговой флоры представителей рода Rhodococcus. Часть выделенных фагов была способна расти на R. ruber и R. qingshengii. Была разработана эффективная методика размножения бактериофага в жидкой культуре R. aetherivorans. Найденные бактериофаги могут быть использованы для разработки эффективных генетических инструментов для Rhodococcus, в том числе и промышленно значимых штаммов.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. Д. Новиков

НИЦ “Курчатовский институт”, Курчатовский геномный центр

Автор, ответственный за переписку.
Email: alexm19@mail.ru
Россия, 123182

И. П. Токмакова

НИЦ “Курчатовский институт”, Курчатовский геномный центр

Email: alexm19@mail.ru
Россия, 123182

А. А. Самарин

НИЦ “Курчатовский институт”, Курчатовский геномный центр

Email: alexm19@mail.ru
Россия, 123182

К. В. Лавров

НИЦ “Курчатовский институт”, Курчатовский геномный центр

Email: alexm19@mail.ru
Россия, 123182

А. С. Яненко

НИЦ “Курчатовский институт”, Курчатовский геномный центр

Email: alexm19@mail.ru
Россия, 123182

Список литературы

  1. Бактериофаги. Биология и практическое применение / Под ред. Э. Каттер, А. М. Сулаквелидзе. М.: Научный мир, 2012. 640 с.
  2. Bubnov D. M., Yuzbashev T. V., Khozov A. A., Melkina O. E., Vybornaya T. V., Stan G. B., Sineoky S. P. Robust counterselection and advanced λRed recombineering enable markerless chromosomal integration of large heterologous constructs // Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. P. 8947–8960. https://doi.org/10.1093/nar/gkac649
  3. Grechishnikova E. G., Shemyakina A. O., Novikov A. D., Lavrov K. V., Yanenko A. S. Rhodococcus: sequences of genetic parts, analysis of their functionality, and development prospects as a molecular biology platform // Crit. Rev. Biotechnol. 2023. V. 43. P. 835–850. https://doi.org/10.1080/07388551.2022.2091976
  4. Guzman J., Vilcinskas A. Draft genome sequence of Rhodococcus rhodochrous strain G38GP, isolated from the Madagascar hissing cockroach // Microbiol. Resour. Announc. 2021. V. 10. Art. e0077721. https://doi.org/10.1128/MRA.00777-21
  5. Kim D., Choi K. Y., Yoo M., Zylstra G. J., Kim E. Biotechnological potential of Rhodococcus biodegradative pathways // J. Microbiol. Biotechnol. 2018. V. 28. P. 1037–1051. https://doi.org/10.4014/jmb.1712.12017
  6. Larkin M. J., Kulakov L. A., Allen C. C. Biodegradation and Rhodococcus – masters of catabolic versatility // Curr. Opin. Biotechnol. 2005. V. 16. P. 282–290. https://doi.org/10.1016/j.copbio.2005.04.007
  7. Liang Y., Jiao S., Wang M., Yu H., Shen Z. A CRISPR/Cas9-based genome editing system for Rhodococcus ruber TH // Metab. Engin. 2020. V. 57. P. 13–22. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2019.10.003
  8. Liang Y. X., Yu H. M. Genetic toolkits for engineering Rhodococcus species with versatile applications // Biotechnol. Adv. 2021. V. 49. Art. 107748. https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2021.107748
  9. Martinkova L., Uhnakova B., Patek M., Nesvera J., Kren V. Biodegradation potential of the genus Rhodococcus // Environ. Int. 2009. V. 35. P. 162–177. https://doi.org/10.1016/j.envint.2008.07.018
  10. Salcedo-Porras N., Umana-Diaz C., de Oliveira Barbosa Bitencourt R., Lowenberger C. The role of bacterial symbionts in triatomines: an evolutionary perspective // Microorganisms. 2020. V. 8. Art. 1438. https://doi.org/10.3390/microorganisms8091438
  11. Summer E. J., Liu M., Gill J. J., Grant M., Chan-Cortes T.N., Ferguson L., Janes C., Lange K., Bertoli M., Moore C., Orchard R. C., Cohen N. D., Young R. Genomic and functional analyses of Rhodococcus equi phages ReqiPepy6, ReqiPoco6, ReqiPine5, and ReqiDocB7 // Appl. Environ. Microbiol. 2011. V. 77. P. 669–683. https://doi.org/10.1128/AEM.01952-10
  12. Yassin A. F. Rhodococcus triatomae sp. nov., isolated from a blood-sucking bug // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005. V. 55. P. 1575–1579. https://doi.org/10.1099/ijs.0.63571-0
  13. Патент СССР. 1990. № SU1731814.
  14. Патент США. 2014. № US20140187818A1.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2024